Ingeniería de datos y biomédica - Murcia, España - Sebibc

Descripción

TÉCNICO/A MÁSTER DE APOYO A LA INVESTIGACIÓNenHospital Clínico Universitario Virgen de la Arrixaca -Servicio de Informática

Los principales objetivos del proyecto para el que se convoca este puesto son:

1- Establecimiento de una Red de Investigación Pediátrica en Enfermedades Raras para la Medicina de Precisión en España

2- Aplicación de estándares de Historia Clínica Electrónica mediante la introducción de un "conjunto mínimo de datos clínicos" en cuatro grupos de enfermedades para obtener un conjunto de estándares comunes de datos clínicos que se pretende incluir en las ERN (Redes Europeas de Referencia), CSUR y CIBER.

3- Implementación de herramientas comunes entre unidades pediátricas y despliegue de "Casos de Uso" para IMPaCT-Data e IMPaCT-Genomics.

4- Aplicación de herramientas automatizadas para analizar y compartir la información genómica de niños con enfermedades raras y la interacción con IMPaCT-Genomics.

El proyecto desplegará una plataforma federada de datos siguiendo las directrices, documentación y demostradores desarrollados por IMPaCT-Data. Este proyecto piloto pretende dar el pistoletazo inicial de la Red nacional, estructurar sus bases mínimas aprovechando los datos fenotípicos y genómicos existentes en 300 pacientes procedentes de 6 centros sanitarios que participan en el estudio piloto y realizar estudios genómicos y análisis fenotípicos estructurados como estudio piloto en otros 200 pacientes con cuatro grupos de patologías. Una vez establecida la Red se pretende ampliar a nivel nacional con el respaldo del Ministerio de Sanidad.

Tareas a realizar por la persona contratada:

1. Identificación de orígenes de datos: Colaboración con los equipos de la Subdirección General de Tecnologías de la Información y Servicio de Informática para identificar las fuentes de datos (bases de datos, archivos, etc) que contienen la información necesaria para el proyecto.
2. Extracción y transformación de datos: Implementación de técnicas para extraer datos de los orígenes identificados y transformarlos en un formato adecuado para su posterior procesamiento.
3. Integración de datos: Integración de los datos procesados en un repositorio centralizado asegurando que estén disponibles para su posterior procesamiento.
4. Modelado de datos OMOP: Generación de un modelo de datos OMOP, que permitirá compartir los datos con la red hospitalaria integrante del proyecto.
5. Realización de análisis y estudios sobre bases de datos OMOP.