Maribel Alcoriza

Procesado y análisis de datos metabolómicos (LC-MS)

Desarrollo de paquetes en R: LipidMS y FAMetA

Actualmente estudiando un Máster de Bioestadística 

Me gradué en Bioquímica y Ciencias Biomédicas en 2015 en la Universitat de València (UV) y, a continuación, hice el Máster en Bioinformática (UV, 2017. Tesis de Master: "LipidMS: a R package for lipid annotation of lipid LC-MS/MS data"). Recientemente me he doctorado en Biomedicina y Biotecnología (UV, 2023. Título: "Development of new bioinformatic tools to improve mass spectrometry-based analysis of the lipidome.") (PFIS, Ref. FI18/00224, ISCIII) en el laboratorio del Dr. Agustín Lahoz (Unidad de Biomarcadores y Medicina de Precisión (UBMP), IIS-La Fe). Actualmente sigo trabajando en la UBMP como responsable del análisis bioinformático de los datos generados en los análisis metabolómicos y lipidómicos mediante espectrometría de masas acoplada a cromatografía líquida (LC-MS).
A lo largo de mi trayectoria he recibido una amplia formación en bioinformática tanto para el procesado y análisis de datos procedentes de LC-MS como de otras técnicas ómicas como NGS o RNA-seq, y he adquirido experiencia en LC-MS, lipidómica, metabolómica y en el uso de trazadores isotópicos estables para el estudio del metabolismo de lípidos. Además, actualmente estoy realizando el Máster en Bioestadística en la UV para complementar mi formación.
Soy primera autora de 4 artículos científicos, 3 de ellos relacionados con el desarrollo de herramientas bioinformáticas dedicadas al análisis de datos lipidómicos. En este sentido, mis contribuciones más relevantes son el desarrollo y el mantenimiento de LipidMS (Alcoriza-Balaguer y García-Cañaveras et al., Anal Chem 2019; Alcoriza-Balaguer et al., Bioinformatics 2022), un software dedicado al análisis de datos lipidómicos obtenidos por LC-MS no dirigida basado en el uso de reglas de fragmentación para las diferentes clases de lípidos; y FAMetA (Alcoriza-Balaguer y García-Cañaveras et al., Briefings in Bioinformatics 2023), un software dedicado al análisis del metabolismo de ácidos grasos basado en la distribución de isotopólogos generada tras incubación con trazadores isotópicos y análisis por LC-MS. Ambas herramientas están disponibles como paquetes de R y como aplicaciones web, las cuales están siendo mejoradas en colaboración con la empresa DISID. El código de ambos paquetes está disponible en github y todos los datos generados en los artículos correspondientes están disponibles en Zenodo. Además, ambas herramientas y sus aplicaciones han sido presentadas en diferentes congresos tanto nacionales como internacionales.
Actualmente, además de la mejora y el mantenimiento de las herramientas mencionadas, mi trabajo en la UBMP se centra en el procesado y análisis bioinformático de los datos metabolómicos y lipidómicos generados en el marco de los proyectos en los que participa la UBMP. Participo en diferentes proyectos a nivel nacional e internacional. Entre ellos, el proyecto europeo "SMARTER: Smart MAnufactuRing for Autologous Cell ThERapies enabled by innovative biomonitoring technologies and advanced process control" financiado por la Comisión Europea (HE EIC Pathfinder Challenges), del que soy la responsable del análisis bioinformático de los datos de metabolómica generados y de la identificación de biomarcadores.

Graduada en Bioquímica 

Máster en Bioinformática 

Doctorada en Biomedicina y Biotecnología

Actualmente estudiando Máster de Bioestadística (60 créditos superados)